昨日,納米孔基因測序上游企業齊碳科技發布了即將量產的納米孔基因測序儀QNome-3841,以及配套芯片和試劑,并宣布其位于成都天府國際生物城的生產基地竣工。
而隨著全新納米孔基因測序儀的量產,納米孔測序技術將在更多應用場景中發揮效用,為生命科學及相關領域的研究及應用提供解決方案。
據齊碳科技聯合創始人兼首席科學家白凈衛博士表示:QNome-3841定位為一款小通量測序儀,8小時可產出1-1.5Gb數據,單次準確率達90%,一致性準確率(50x)達99.9%,公司內部已使用此款設備完成了讀長大于300Kb的測序實驗。此外,QNome-3841還能為用戶提供一站式數據分析平臺。
QNome-3841
據他介紹,這款產品因直接測序、實時、小巧便攜等特點,特別適合小型實驗室、戶外及對時效性要求高的應用場景,“例如臨床應用時,可以做到來一個樣本測一個樣本,無需湊樣,可大大縮短測序時間”。
另外,白凈衛博士還透露了齊碳科技過去一年里在納米孔蛋白、生物芯片等核心技術方面取得的突破,譬如最新一代自主研發的K2系列納米孔蛋白,在沒有進行basecall算法的優化下,單次準確率已達到95%;此外研發了基于有機基材和硅基材的兩種流體芯片,耗材可拆卸,能有效降低測序成本,同時還完成了自主ASIC芯片設計,全流程國產化生產。
在此之前的2020年9月,齊碳科技發布了自主研發的納米孔單分子基因測序儀,基于該產品的Alpha Test今年5月正式啟動。
齊碳科技聯合創始人謝丹博士表示,在Alpha Test階段,齊碳科技與病原體研究、遺傳病研究、腫瘤研究、司法刑偵、動植物保護等領域的頭部企業、高校、科研院所等多家機構開展合作,涉及70多個項目,1500多個樣本。項目涵蓋土壤宏基因組測序、疾病檢測、物種鑒定、基因組組裝、病毒分型、臨床病原檢測等。
在這些合作項目中,通過利用納米孔基因測序儀QNome-9604對大量細菌、病毒和人類基因組樣本進行測序,已累計輸出800Gb數據。而這些數據也為將來更多的創新研究,提供有力支撐。
據謝丹博士介紹,在Alpha Test階段,“單張芯片的最大孔數為325、最大數據量產出為1420Mb、最大N50為36Kb,最長reads為290Kb。這也意味著QNome-9604產品的性能和可靠性符合預期,可以滿足下游應用端用戶的需求?!?/p>
Alpha Test階段相關數據
隨后,他還分享了Alpha Test階段在血流感染宏基因組檢測、細菌基因組組裝、法醫領域SNP位點測序、腫瘤融合基因檢測等6個典型案例,展現了納米孔基因測序技術在多個應用場景中的優勢和廣闊的市場前景。
以法醫領域為例來看,四川大學華西基礎醫學與法醫學院侯一平教授就指出,全球法醫實驗室廣泛使用DNA檢測來偵破刑事案件。DNA測序對序列結構解析的優勢有益于法醫DNA分析。便攜的納米孔測序儀更加適用于犯罪現場分析,近來也逐漸在法醫領域嶄露頭角。
最后,齊碳科技CEO胡庚博士表示,“當前的技術和產品僅僅是一個開始,未來齊碳將不斷加速技術、產品和場景的探究步伐,為用戶提供各個場景下‘從樣本到結果’的基因測序解決方案?!?/span>
36氪獨家|攻克基因測序“卡脖子”技術,齊碳科技獲超4億元B輪融資,鼎暉、高瓴聯合領投